प्रधानमंत्री अटल बिहारी वाजपेयी उस समय अपनी असहमति दर्ज कराना चाहते थे, जब भाजपा संसदीय बोर्ड ने गुजरात दंगों को लेकर नरेंद्र मोदी को गुजरात के मुख्यमंत्री पद से हटाने की उनकी मांग को भारी बहुमत से खारिज कर दिया। पूर्व उपराष्ट्रपति वेंकैया नायडू की नई बॉयोग्राफी में यह बात लिखी गई है।