एनसीईआरटी अपनी पाठ्यपुस्तकों को लेकर फिर से विवाद में है। पहले तो बाबरी मस्जिद विध्वंस और लालकृष्ण आडवाणी की राम रथयात्रा को पाठ्यक्रम से हटा दिया गया। और जब इस पर सवाल पूछे गए तो एनसीईआरटी निदेशक दिनेश प्रसाद सकलानी ने तर्क भी अजीब दिया है। हालिया बदलावों को लेकर उठे विवाद के बीच उन्होंने कहा है कि घृणा और हिंसा शिक्षा के विषय नहीं हैं और स्कूली पाठ्यपुस्तकों में इन पर ध्यान नहीं दिया जाना चाहिए।