निज्जर हत्याकांड मामले में अब प्रधानमंत्री नरेंद्र मोदी का नाम सामने आया है। कनाडाई अख़बार ने दावा किया है कि प्रधानमंत्री नरेंद्र मोदी को खालिस्तानी आतंकवादी हरदीप सिंह निज्जर की हत्या की साजिश के बारे में पता था। भारत सरकार ने कनाडाई अखबार की रिपोर्ट को खारिज कर दिया है और कहा है कि यह हास्यास्पद रिपोर्ट है।