असम के मुख्यमंत्री हिमंता बिस्वा सरमा ने विज्ञान और प्रौद्योगिकी विश्वविद्यालय मेघालय को जिहादी यूनिवर्सिटी बताया था। लेकिन केंद्र सरकार की रैंकिंग में इस यूनिवर्सिटी को नेशनल रैंकिंग मिली है। नॉर्थ ईस्ट राज्य की यह एकमात्र प्राइवेट यूनिवर्सिटी है जिसे नेशनल रैंकिंग मिली है। विपक्षी दल असम के मुख्यमंत्री को बेसिर पैर के आपत्तिजनक बयान देने वाला भाजपा नेता कहते हैं।